Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00523Q86TU6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms