Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDZD4Q76G19 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms