Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms