Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms