Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00303Q3SY05 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00303Q3SY05 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00303Q3SY05 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00303Q3SY05 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00303Q3SY05 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00303Q3SY05 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00303Q3SY05 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00303Q3SY05 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LINC00303Q3SY05 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00303Q3SY05 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00303Q3SY05 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00303Q3SY05 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00303Q3SY05 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00303Q3SY05 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00303Q3SY05 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00303Q3SY05 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00303Q3SY05 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC00303Q3SY05 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC00303Q3SY05 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC00303Q3SY05 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC00303Q3SY05 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00303Q3SY05 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LINC00303Q3SY05 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00303Q3SY05 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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