Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPHKAPQ2M3C7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms