Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC142Q17RM4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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