Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IMPG1Q17R60 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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