Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LTC4SQ16873 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms