Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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SGCAQ16586 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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