Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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E2F4Q16254 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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E2F4Q16254 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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E2F4Q16254 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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E2F4Q16254 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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E2F4Q16254 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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E2F4Q16254 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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E2F4Q16254 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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E2F4Q16254 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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