Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDCD1Q15116 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDCD1Q15116 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PDCD1Q15116 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PDCD1Q15116 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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