Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms