Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms