Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A3Q14050 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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