Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF5Q13568 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms