Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CALCOCO2Q13137 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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