Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HSPB3Q12988 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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