Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC173Q0VFZ6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms