Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms