Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALD1Q05682 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms