Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GCNT1Q02742 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms