Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms