Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms