Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK16Q00536 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms