Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HBA1P69905 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HBA1P69905 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HBA1P69905 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HBA1P69905 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HBA1P69905 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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