Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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