Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OXCT1P55809 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms