Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NESP48681 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NESP48681 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NESP48681 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NESP48681 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NESP48681 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NESP48681 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NESP48681 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NESP48681 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NESP48681 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NESP48681 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NESP48681 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NESP48681 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NESP48681 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NESP48681 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NESP48681 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NESP48681 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NESP48681 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NESP48681 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms