Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF5P43026 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF5P43026 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms