Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARL1P40616 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARL1P40616 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms