Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGCXP38435 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms