Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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