Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms