Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms