Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms