Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRCP23327 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRCP23327 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRCP23327 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRCP23327 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms