Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMY2BP19961 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms