Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBSLP0DN79 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms