Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPIND1P05546 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPIND1P05546 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPIND1P05546 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPIND1P05546 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms