Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYBBP04839 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYBBP04839 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYBBP04839 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms