Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PRB1P04280 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PRB1P04280 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PRB1P04280 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PRB1P04280 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PRB1P04280 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PRB1P04280 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PRB1P04280 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PRB1P04280 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms