Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPLO60437 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPLO60437 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPLO60437 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPLO60437 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms