Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
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BCKDKO14874 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BCKDKO14874 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BCKDKO14874 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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BCKDKO14874 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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