Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBXN8O00124 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms