Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms