Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HMX2A2RU54 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms