Protein–RNA interactions for Protein: S4R3F8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3F8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
S4R3F8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
S4R3F8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
S4R3F8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
S4R3F8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
S4R3F8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
S4R3F8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
S4R3F8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
S4R3F8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
S4R3F8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
S4R3F8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
S4R3F8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
S4R3F8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
S4R3F8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
S4R3F8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms