Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAD1L1Q9Y6D9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAD1L1Q9Y6D9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms