Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00312Q9Y6C7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms